A Tanganyika felszabadító harcát a Tanganyika Afrikai Nemzeti Egyesület vezette, amelynek zászlója zöld-fekete-zöld vízszintes háromszínű volt. A választások megerősítették a szervezet túlnyomó többségét, és a brit hatóságok azt javasolták, hogy a párt lobogóját nemzeti zászlóként való felhasználására módosítsák az 1961. december 9-i függetlenség utáni időszakban. Abban az időben sárga hullámokat adtak hozzá.
Az arab uralom alatt Zanzibár már régóta vörös zászlót repült, de egy fekete afrikai rezsim hatalomba került 1964. január 12-én, fekete, sárga és kék zászló alatt. A következő hónapban az uralkodó Afro-Širazi Párt új, a saját zászlóhoz hasonló nemzeti zászlót vezetett be. A vízszintes kék-fekete-zöld csíkok a tengerre, az emberekre és a földre vonatkoztak, míg a keskeny, fehér függőleges csík az emelőnél békét jelentett.
1964 áprilisában Tanganyika és Zanzibar országai egyesültek, és július elején lobogójuk hagyományait összeolvadták Tanzánia új nemzeti zászlójának létrehozása érdekében. A zászló színeit átlósan építették be a megkülönböztethetőség érdekében. Az ország többségét a fekete csík jelképezi, míg a zöld a föld gazdag mezőgazdasági erőforrásait jelképezi. Az ásványi gazdagságot a keskeny, sárga szegély tükrözi, míg az Indiai-óceánt a kék jelképezi. Miután Zanzibar és Tanganyika egyesült, a Zanzibár zászlót továbbra is helyben használták ezeken a szigeteken.
