Harmadik udvar
A Felicity lombkorona kapuja a harmadik udvarhoz, vagy a legbelső udvarhoz vezet, ahol a szultán magánlakása és a belső palotaiskola található. Csak a szultán, családtagjai, szolgái és az alkalmilag elfogadott látogató léphetett be. A szultán látogatói csak olyan messzire tudtak menni, mint a Közönség Kamara, és elvárták, hogy szigorú szokásokat kövessék. Nem tudtak kapcsolatba lépni velük, vagy közvetlenül a szultánnal beszélni, ehelyett leengedték a fejüket, lefelé dobták a szemüket és beszélgettek a szultán fordítójával.
Mielőtt III. Murad a 16. században hárembe költözött, a szultán apartmanjai a Szent Emlékek Kamaraként nevezett épület harmadik udvarán voltak. A név abból adódik, hogy az iszlám emlékek tárolójaként szerepel, beleértve a Muhammad próféta köpenyét, kardját és íját, amelyek mindegyikét akkor szerezték meg, amikor I. Selim meghódította az Egyiptomban található Mamlūk-dinasztia 1517-ben eljuttatott kalifátust az oszmánok felé.
A királyi oldalak kollégiumai, amelyek a szultán szolgáinak hierarchiájába tartoztak, szintén a harmadik udvarban találhatók. A legtöbb oldalt fiúként toborozták a meghódított keresztény lakosságból a devşirme rendszeren keresztül, amelyben a fiúkat adó vagy haszon formájában távolították el családjukból. Miután új neveket kaptak, és az iszlámmá alakultak, a legfényesebb fiúknak konkrét szerepeket kaptak, és szigorú oktatásban részesültek, miközben keresettek. Meritokráciát követtek és olyan magas rangú pozíciókat kapták meg, mint nagy vizír, de sokan 25 éves korukban szabadultak fel és házba vettek egy háremi lányt vagy a szultán lányát. A királyi oldalak kollégiumai ma a császári gyűjtemények részeit tartalmazzák. Például a szultánok portrék a Kivilágított Kamara kollégiumában találhatók, a császári szekrény pedig a Kampányok kollégiumában található. Mindkét gyűjtemény számos tárgya bemutatja a palota kézműveseinek készségét, valamint a technikák és a divat változásait. A nézők a 19. században a ruha jelentős változását láthatják például a szekrény és a portrégyűjtemény segítségével, amikor az európai katonai ruházat váltotta fel a szultán kaftánját, a fez pedig a turbánt.
A palota egyik leghíresebb gyűjteménye a császári ékszerek gyűjteménye, mely a Hódító pavilonjában, a harmadik udvaron is található. A gazdaságok között szerepel az úgynevezett Spoonmaker's Diamond, a világ egyik legnagyobb vágott gyémántja, és a smaragdzöld Topkapı Dagger, amely az 1964-es Topkapi kaprofilm érdeklődésének tárgya. Mint a múzeum gyűjteményének többi része, az ékszergyűjtemény igazolja az Oszmán Birodalom nagy gazdagságához.
A harmadik udvar közepét III. Ahmed Szultán könyvtára foglalja el, amelyet pazarul díszítik, mint a palota számos épületét festett csempékkel, ólomüveg ablakokkal és redőnyökkel, gyöngyház és elefántcsont díszítéssel. A könyvgyűjteményt a 20. században a többi palotakönyvvel konszolidálták, és az Aghas mecsetbe költöztették, amely a palota legnagyobb mecsetje és szomszédságában található. A Topkapı-palota gyűjteménye ritka kéziratokat, illusztrált köteteket és a Korán korai példányait tartalmazza, amelyeket a kutatók átnézhetnek az olvasóteremben.
Negyedik udvar
A harmadik udvar a negyedik udvarra terjed ki, amely elsősorban teraszos kertekből és pavilonokból áll. Itt található a szépen díszített körülmetélési terem, a Bagdad Pavilon és a Jereván pavilon. A negyedik udvar egyik legszembetűnőbb építménye a furcsa aranyozott bronz Iftar Pergola, ahol a szultánok gyorsan megtörik, ha Ramadan nyáron esik. Számos oszmán szultán érdeklődött a virágok és a kertészkedés iránt, és a negyedik udvari kertet tulipánok töltik meg, akárcsak az oszmán uralom idején.
Hárem
A hárem a szultán család lakónegyede volt, és szigorúan nem szerint osztották fel. A XVI. Században ez is a szultán rezidenciájává vált, amikor III. Muradnak lakások épültek. A palota többi részéhez hasonlóan a háremet is folyamatosan felújították, és szükség szerint növekedett. Az eredmény egy meglehetősen kis méretű elrendezés és sok építészeti stílus.
A hárembe való belépéshez vagy az onnan való kilépéshez a lakosoknak át kellett menniük a fekete eunuchok burkolt udvarán a Főkapu felé, amelyet más néven a Királyi Kapunak is neveznek. A fekete eunuchok őrizték a háremet, és valószínűleg a meghódított területek rabszolga piacán vásároltak meg és a pubertás előtt kasztráltak. Mint a királyi oldalak, az eunuchok fizetést kaptak és meritokráciát követtek el, ám az oldalaktól eltérően csak néhány eunucht szabadítottak fel. Lakóhelyiségeik, valamint a Kincstárnoki Kamara és a Hercegek Iskolája körülvették ezt az udvart.
A főkapu mellett a Királynő Anya járdalapi udvara, a hárem legnagyobb és legközpontibb udvara. A királynő anya volt a harem hatalmának központja. A valid szultánnak hívták, ő volt a fő konzorcium, akinek a fia a trónra emelkedett. Jelentős befolyást gyakorolt a szultán felett is, aki minden reggel megáll a központi elhelyezkedésű apartmanjaiban, hogy tájékoztassa az államügyeiről.
A szultán apartmanjai egy fehér márványos kettős hammam, egy török fürdő útján kapcsolódtak a királynőhez. A hammam egyik oldalát a szultánnak, a másikat a hárem nőknek tartották. A szultán rezidencia többi része tróncsarnokot és három fürdõkamrát tartalmaz. A III. Murad Privát szoba a hárem legrégibb és legjobban fennmaradt épülete, amelyet az Oszmán Birodalom egyik legismertebb építésze, Sinan tervezett. A kupolás helyet İznik csempe és a Korán verseket idéző kalligráfia díszíti. Egy másik, Fruit Room-nak hívott szobát III. Ahmed adta hozzá, és jellegzetesen finoman lakkozott gyümölcsökkel és virágokkal díszített.
A szultán fiai, lányai, testvérei szintén a háremben éltek, és a hárem száz szobájának egyikét elfoglalták. Például a ikerpavilonok valószínűleg a szultán fiainak a 18. században kezdődő lakónegyedében voltak.
A háremnek otthona volt a női szolgáknak, ágyasoknak és a szultán fõ konzorciumainak is, és a helyiségek hozzáférhetõk voltak a Fő kapu elõtt lévõ Ágyak Galéria oldalán. Ezek közül a nők közül sokan ajándékoztak vagy vásároltak a rabszolgapiacról, amikor fiatal lányok voltak, és a palota többi szolgájához hasonlóan, meritokratikát követtek. Szolgas feladatokat vállaltak, miközben fizetést és képzést kaptak, hogy feleségül váljanak az egyik oldalra, vagy ágyasak a szultán számára. Ha ágyas lesz egy ágyas, egy fiatal nő fel tud emelkedni a soraiban és jobb szállást kaphat, lényegében tehát, ha gyermeket született a szultánnak. Ha a gyerek egy olyan férfi volt, aki feljött a trónra, az ágyas a vérrel a harem legerősebb helyzetét veszi át, mint a királynő anya. A hárem legtöbb lányát azonban 16 vagy 17 éves korukban szabadították fel, és képzésük után házasok voltak.
