Gélkromatográfia, más néven Gel Filtration, az analitikai kémiában a kémiai anyagok elválasztásának technikáját a porózus, félszilárd anyag ágyán való áthaladás sebességének különbségeinek kihasználásával. Ez az eljárás különösen hasznos enzimek, fehérjék, peptidek és aminosavak elválasztására egymástól és az alacsony molekulatömegű anyagoktól. A keverék alkotóelemeinek gélkromatográfiával történő elválasztása a komponensek molekuláris méretének különbségein alapszik. A kis molekulák hajlamosak diffundálni a porózus részecskék belsejébe úgy, hogy áramlásuk korlátozott legyen, míg a nagy molekulák nem képesek belépni a pórusokba, és akadálytalan módon hajlamosak áramolni. Így a legnagyobb molekulatömegű alkotóelemek először távoznak az ágyból, majd egymás után kisebb molekulák. Az ágyanyagok a legelterjedtebben alkalmazott poliakrilamid és dextránból és epiklórhidrinből előállított polimer. A száraz polimereket általában megfelelő reagensekben szuszpendálják, hogy homogén, félszilárd keveréket képezzenek.
