Amikor a szovjetek hatalomra kerültek Nyugat-Törökországban, egyenlőséget és fejlődést ígérve minden etnikai csoport számára, a kirgizok 1924-ben megszerezték saját autonóm régiójukat. 1926-ban autonóm köztársaság státusra emelték, 1936-ban pedig unióvá vált. köztársaság a Szovjetunióban 1953-ban a Kirgiz SSR elfogadta a szovjet vörös zászló módosított változatát egy fehér szegélyű kék vízszintes csík hozzáadásával a középponton. Miután Kirgizisztán 1991. augusztus 31-én kihirdette függetlenségét, 1992. március 3-ig folytatta szovjet zászlójának használatát.
Az új zászló háttere, amelyet ma is használnak, szintén vörös, de azt állították, hogy a kirgiz nemzeti hős, a nemes Manas zászlajából származik. A zászló közepén egy sárga nap van, 40 sugarakkal, amelyek megfelelnek Manas és az ő egyesített törzsek követõinek; további szimbolikus tulajdonságai a fény, a nemesség és az örökkévalóság. Ezen a napon egy vörös és sárga embléma van, két keresztbe helyezett három sorból álló sorozattal, mindegyik gyűrűn belül. Ez a hagyományos kirgiz otthon, a jurta tetőjének stilizált képe. Kevés kirgiz továbbra is juurtban él, de a 20. század közepéig a nomád emberek többsége jurtákat állított fel, bárhová is utazott. Ennek a tervezésnek a szimbolikus jelentése bonyolult: a zászlótörvény az élet eredetéről, az idő és a tér egységéről, a kirgiz nép történetéről, a szolidaritásról, valamint a kandallóról és az otthonról szól.
