Új vírustörzsek fejlődése
Az állatokat megfertőző vírusok egyik fajról a másikra ugorhatnak, új, általában súlyos betegséget okozva az új gazdaszervezetben. Például 2003-ban a Coronaviridae családban egy vírus az állati tartályból, amelyről úgy gondolják, hogy patkó-denevérek, az emberre ugrott, és az emberekben nagyon patogén betegséget okozott, úgynevezett súlyos akut légzőszervi szindrómát (SARS). A SARS koronavírus azon képessége, hogy a patkó denevérekről emberre ugorjon, kétségtelenül a vírus genetikai változásait igényelte. A változások feltételezhetően a palm-civetben fordultak elő, mivel a patkó denevérekben található SARS vírus nem képes közvetlenül megfertőzni az embereket.
Az ilyen újonnan megjelenő vírusok gyakran erősen fertőzőek az emberekben, mivel az emberi immunrendszer korábban nem találkozott velük, így az emberek immunitásuk nincs ellenük. A SARS-t kiváltó koronavírus gyorsan elterjedt az emberek között, és jelentős betegségveszélyt jelent. A vírust az utazási tilalmak és a karantén intézkedések miatt gyorsan ellenőrzés alá vonták. 2019 végén egy másik típusú koronavírus, a SARS-CoV-2, Kínában alakult ki, és gyorsan elterjedt az egész világon, pandémiát okozva. A SARS-CoV-2 a 2019-es koronavírus betegségnek (COVID-19) néven ismert betegséget okozott, amely nagyon hasonló volt a SARS-hoz, de szignifikánsan nagyobb mortalitást okozott, különösen a 65 év felettieknél.
Az A-influenza vírusok, amelyek megfertőzik az embereket, drámai antigénváltáson mennek keresztül, úgynevezett antigéneltolódásnak, amely vírusokat generál, amelyek pandémiákat okoznak. Ez a drámai változás azért fordul elő, mert az A-influenzavírusnak nagy állattartója van, vad vízi madarak. Az influenza A vírusok RNS-genomja nyolc szegmens formájában van. Ha egy közbenső gazdaszervezetet, valószínűleg a sertést, egyidejűleg megfertőztetik egy emberi és egy madárinfluenza-A vírussal, akkor a genom RNS-szegmenseit újból meg lehet osztani, így olyan új vírust kapunk, amelynek felszíni fehérje immunológiailag különbözik az A-influenza vírusokétól, amely keringtek az emberi populációban. Mivel az emberi populáció kevés immunológiai védelemben részesül, vagy egyáltalán nincs védelem az új vírus ellen, pandémiát eredményez. Ez valószínűleg az 1957-es influenzajárványban, az 1968-as influenzajárványban és a 2009-es influenzajárványban (H1N1) történt.
A pandémiás influenza A vírusok nyilvánvalóan más mechanizmusok révén is felmerülhetnek. Feltételezték, hogy a törzs, amely az 1918–1919 közötti influenzajárványt okozta, mind a nyolc RNS-szegmenst egy madárvírusból származtatta, és ez a vírus azután többszörös mutációkon ment keresztül az emlős sejtekhez való alkalmazkodás során. Úgy tűnik, hogy az 1990-es évek óta Ázsiából Európába és Afrikába terjedő madárinfluenza-vírusok ezen a módon járnak el a pandémiás képességgel. Ezek a vírusok, amelyeket a csirkékből közvetlenül átterjedtek az emberekre, csak madárgéneket tartalmaznak és erősen patogének az emberekben, 50% -ot meghaladó halálozási arányt okozva. A madárinfluenza-vírusok még nem szerezték meg azt a képességüket, hogy hatékonyan terjedjenek az emberekről az emberekre, és nem ismert, hogy milyen genetikai változásoknak kell bekövetkezniük ahhoz, hogy ezek megváltozzanak.
