Roderick MacKinnon (született 1956. február 19-én, Burlington, Massachusetts, USA), amerikai orvos, a 2003. évi Nobel-kémiai díj központi tudósa, sejtmembránok ioncsatornáinak úttörő kutatása miatt. A díjat megosztotta Peter Agre-vel, aki szintén az Egyesült Államokból származik.
MacKinnon 1982-ben MD diplomát szerzett a Tuftsi Egyetemi Orvostudományi Egyetemen. Miután több éven át orvosi gyakorlatot folytatott, alapkutatásba kezdett, 1986-ban kezdődött a Brandeis Egyetemen az ioncsatornák doktori doktori munkájával. 1989-ben csatlakozott a Harvard Egyetemhez, és 1996-ban egyetemi tanárként és laboratóriumi vezetőként a Rockefeller Egyetemen költözött. Egy évvel később kutatóvá nevezték ki a Rockefeller Howard Hughes Orvosi Intézetében.
Különösen fontos az idegrendszer és a szív számára, hogy az ioncsatornák a sejtmembránok speciális nyílásai, amelyek lehetővé teszik az ionok, például a kálium és a nátrium bejutását a sejtekbe és azokból; hasonló struktúrák léteznek a víz áthaladására is. A MacKinnon úttörő munkája a „szűrőkre” összpontosított olyan csatornákban, amelyek áthaladtak egyfajta ionon, míg másokat blokkoltak. Ahhoz, hogy megértsük, hogyan működnek ezek a szűrők, élesebb képet kapott a csatornákról röntgendiffrakció segítségével. 1998-ban meghatározta az ioncsatorna háromdimenziós molekuláris szerkezetét. A csatorna, amelyet a MacKinnon felfedezett, olyan felépítésű, hogy a káliumionokat - de nem a nátriumionokat - könnyen eltávolítja a hozzájuk kapcsolódó vízmolekulákból, és lehetővé teszi számukra a csúszást. A cellának a legközelebbi csatorna végén talált egy molekuláris „érzékelőt”, amely reagál a cella körüli körülményekre, jeleket küldve, amelyek a csatornát a megfelelő időben nyitják és zárják. Úttörő munkája lehetővé tette a tudósok számára, hogy folytassák gyógyszerek kifejlesztését olyan betegségek számára, amelyekben az ioncsatornák szerepet játszanak.
