Michael Haydn, teljes Johann Michael Haydn (1737. szeptember 14-én keresztelkedett, Rohrau, Ausztria - 1806. augusztus 10-én halt meg Salzburgban), a 18. század későbbi templomazene egyik legjobban teljesített alkotója. Ő volt Joseph Haydn fivére.
Mint a testvére, Michael Haydn kórusfiú lett a bécsi Szent István-székesegyházban, ahol ott korai zenei oktatást kapott. Amikor elhallgatta a hangja, elbocsátották a kórusiskolából, majd szabadúszó zenészként bizonytalan megélhetést keresett. 1757-ben a magyarországi Groswardein püspök kapellmeisterévé vált (ma Nagyvárad, Románia), és 1762-ben a salzburgi érsek koncertmesterévé vált. Életének hátralévő részében Salzburgban koncertmester maradt, majd 1781-ben Wolfgang Amadeus Mozart lett a székesegyház orgonistája.
Életében Michael Haydnt jobb templomi zeneszerzőnek tartották, mint testvérét. Az általa írt sok mű közül a Missa a due cori (más néven Missa Hispanica; 1786) kiemelkedő mű a zenekar és az énekes szólisták számára. 1771-es Requiem befolyásolta Mozart saját híres 1791-es Requiemjét. Haydn számos szimfóniát írt, divertimenti és más világi kompozíciók. Ő volt Mozart barátságos barátja (aki hegedű-brácsa duóját írta egy megbízás teljesítéséhez, amelyet Haydn túl beteg volt ahhoz, hogy teljes legyen), és Carl Maria von Weber tanára volt. Halála után Haydn hírneve hosszú árnyékolást szenvedett, és érdemeit csak a második világháború után elismerték újra.
