A dinamikus első miniszterelnök, Barthélemy Boganda vezetésével 1958. december 1-jén kihirdették az autonóm köztársaságot. A nemzet korábban Ubangi-Shari (Oubangui-Chari) francia kolónia volt, de Boganda átnevezte Közép-afrikai Köztársaságnak. megtervezte nemzeti zászlóját. A lobogó felépítésében nem történt változás sem a teljes függetlenség elérésekor, 1960. augusztus 13-án, sem az 1976–79 között, amikor Jean-Bédel Bokassa katonai vezető átvette a császári köpenyt a Közép-afrikai Birodalom bejelentésével.
Boganda zászlóterve szimbolikusan kifejezte annak felismerését, hogy Franciaországnak és Afrikának együtt kell menetelnie. A francia Tricolor kék, fehér és piros színét kombinálta a pánafrikai vörös, sárga és zöld páfrázzal, hogy megmutassa a két civilizáció közötti szolidaritást. Sárga csillag jelent meg az emelő sarkában a jövőbeli haladás útmutatásaként és az egység jelképeként. Kék állítólag a szabadság, a nagyság és az ég, míg a fehér a tisztaság, az egyenlőség és az őszinteség mellett állt. Zöld képviselte a nemzet erdőit, a sárga a szavannákat, a piros pedig az egész emberiség vérét jelentette. Az európaiak és az afrikaiak közötti kapcsolat a piros négy függőleges csíkban nyilvánul meg, amely áthaladt a másik négy színben.
