A vitatott 2010-es elnökválasztás
A polgári konfliktus és annak következményei miatt a 2005-re tervezett elnökválasztást a következő néhány évben többször elhalasztották. Amikor a választások első fordulóját végül megtartották, 2010. október 31-én Ouattara volt az RDR jelölt. A szavazatok 32 százalékát nyerte el, a második helyen állva a 38 százalékkal nyert Gbagbo mögött, és a kettő eljutott a második szavazási fordulóra, amelyet november 28-án tartottak. 2010. december 2-án az ország választási bizottsága bejelentette, hogy Ouattara nyeri a választásokat a szavazatok 54 százalékával, de az Alkotmánytanács másnap megemlítette az állítása szerint számos szabálytalanságot, és az eredmények egy részét diszkontálta. Ezt követően Gbagbo lett a győztes, a szavazatok 51 százalékával.
Az Ouattara-t a legtöbb nemzetközi közösség - köztük az ENSZ, amely igazolta a kezdeti eredményeket - jogszerű győztesnek tartotta, és az ország északi részét irányító lázadó csapatok támogatták. Ennek ellenére Gbagbo, akit az ország katonai és legfelsõbb kormányzati szintje támogatta, újabb elnöki posztra esküdött be. Eközben Ouattara esküt tett magának elnökeként és párhuzamos kormányt alakított ki, amely az ENSZ békefenntartó erõinek védelme alatt álló Abidjan szállodában található. A politikai álláspont attól tartott, hogy az ország ismét polgári konfliktusba süllyed, és az Afrikai Unió megpróbált közvetíteni. Ennek ellenére a kihagyás hónapokig folytatódott, és erőszakossá vált, mivel a harcok fokozódtak a Gbagbóra hűséges erők és az Ouattárat támogatók között, politikai, gazdasági és humanitárius dimenzióval járó válságot idézve elő, amely még akkor is megmaradt, miután Gbagboot 2011. április 11-én letartóztatták., és kikapcsolták az áramellátást. (További részletek: Elefántcsontpart: A 2010. évi vitatott választás és az elhúzódó politikai állásfoglalás.)
Gbagbo letartóztatása kiküszöbölte Ouattara elnökségének a legfrissebb kihívást. Ouattara ezután megvizsgálta a nehéz stabil feladatokat: a gazdasági stabilitás helyreállítása, a humanitárius válság enyhítése és az ország újraegyesítése, amely a 2002–2003-as polgárháború óta megosztott volt. Elő kellett mozdítania a megbékélést Gbagbo támogatói és a sajátja között is. E célból Ouattara felszólította a harcok beszüntetését és megígérte, hogy igazságügyi és megbékélési bizottságot fog létrehozni a két fél állítólag elkövetett bűncselekmények és emberi jogi visszaélések kivizsgálására; később azt kérte a Nemzetközi Büntetőbíróságtól, hogy vizsgálja meg az utólagos erőszakot is. Az alkotmánytanács 2011 májusában megváltoztatta 2010. decemberi határozatát, és Ouattara-t elismerte az elnökválasztás győzteseként. Hivatalosan esküt tették május 6-án, nyilvános beiktatásával és ünneplésével május 21-én.
Elnökként Ouattara képes volt elősegíteni az ország lenyűgöző gazdasági fellendülését, jóllehet egyes fülöp-szigeteki panaszkodott, hogy a gazdasági haladás nem volt elég messze ahhoz, hogy segítsen enyhíteni a szegénységet. Kritika volt az is, hogy korábbi ígéretei ellenére Ouattara még nem tett eleget a megbékélés és az igazságosság szükségességének kezelésére a 2010-es választási válság nyomán. Ennek ellenére Ouattara volt a 2015. évi október 25-i elnökválasztás első helyezettje. Bár néhány ellenzéki jelölt visszavonult a választásokból és bojkottot kért, a szavazók több mint 50 százaléka kiderült, és Ouattárt a szavazatok csaknem 84 százalékával választották meg.
